- 氣相色譜的板理論
- 氣相色譜的基本理論與液相色譜的基本理論相似,一些基本原理和基本關(guān)系式都可直接應(yīng)用。例如等溫線與色譜峰形狀之間的關(guān)系,若為線性等溫線,所得之色譜峰是對稱的高斯形曲線,若為凸形或凹形等溫線則將得到拖尾峰或前沿峰。
- 甲烷和分子氧的活化機(jī)理
- 甲烷和分子氧的活化機(jī)理:甲烷單加氧酶的催化反應(yīng)循環(huán)是羥基化酶MMOHox,在還原酶的作用下先從NADH接受兩個電子,變?yōu)檫€原態(tài)。然后還原態(tài)的MMOHred與分子氧作用,經(jīng)過兩種中間態(tài)0和P,脫去水后形成中間物Q,Q與底物結(jié)合,再經(jīng)過兩種過渡態(tài)形式R和T,釋放出產(chǎn)物,并重新回到氧化態(tài)的MMOH,如圖3-10所示。要證明這一反應(yīng)機(jī)理的有效性,就必須設(shè)法檢測到在催化反應(yīng)循環(huán)中,MMOH的雙鐵核中心與分子氧和反應(yīng)底物形成中間化合物。
- 甲烷直接催化氧化制甲醇
- 甲烷直接催化氧化制甲醇是甲烷單加氧酶最基本的催化反應(yīng),在自然界已發(fā)現(xiàn)的天然酶中,只有甲烷單加氧酶具有這一催化功能。目前,被公認(rèn)的反應(yīng)機(jī)制是甲烷單加氧酶中的羥基化酶(MMOH)、還原酶(MMOR)和調(diào)節(jié)蛋白B (MMOB)必須協(xié)同作用,才能活化甲烷和分子氧,將一個氧原子插入到甲烷的C--H鍵中生成甲醇,因此甲烷單加氧酶是包含三個組分的酶系。和其它氧化還原酶一樣,為了活化分子氧,在反應(yīng)中還需要輔酶NADH作為電子給體,還原酶能從NADH接受電子,將其傳遞給羥基化酶:而調(diào)節(jié)蛋白B則在還原酶和羥基化酶之間
- 氣相色譜的流程及色譜圖
- 對于流出氣體中被分離組分的檢測及測量方法可分為二類:積分式檢測和微分式檢測。前者是將流出氣體中各組分所產(chǎn)生的信號加和性地記錄下來,因此洗脫曲線(檢測信號對時間或流出物的容積作圖)為一系列階梯形曲線(圖15-2a);而微分式檢測器記錄流出氣體的某一瞬間的性質(zhì),因此以載氣為基線,各組分則以對稱峰形出現(xiàn)(圖15-2b)。
- 甲烷單加氧酶還原酶MMOR的結(jié)構(gòu)
- Muller等采用NMR結(jié)合局城性分子動力學(xué)計算研究了MMOR的結(jié)構(gòu)[]表明,還原酶(sMMOR)有2個城,一個是含有FAD和NADH結(jié)合部位MMOR-FAD城,分子量為27. 6kDa,由250(99~348)個氨基酸組成;另一個是含有[2Fe-2S] 的鐵氧化還原蛋白城(MMOR-Fd), 由98(1~98)個氨基酸組成,6個β帶(strands), 3個a螺旋構(gòu)成了2個β片, [2Fe-2S]中心與42、47、50、82半胱氨酸殘基的硫原子配位,分子量為10. 9kDa,MMOR總分子量為
- 甲烷單加氧酶調(diào)節(jié)蛋白MMOB的結(jié)...
- 調(diào)節(jié)蛋白B的分子量大約是16kDa,由7條β鏈構(gòu)成兩個β帶,這2個β 帶成直角,通過3個a螺旋,互相垂直交聯(lián)在一起,鄰接部分呈現(xiàn)螺旋趨勢,但較混亂。N端易受蛋白影響發(fā)生水解,N端水解后縮短了MMOB的鏈長度?;蛑亟M的MMOB與天然MMOB相比,和MMOH結(jié)合的親和性有所降低。甲烷羥基化反應(yīng)的效率,取決于MMOH和MMOB在催化過程中的相互作用動力學(xué)。整個蛋白質(zhì)表面呈現(xiàn)疏水性,在酶系統(tǒng)反應(yīng)中只對MMOH一些關(guān)鍵部位的結(jié)構(gòu)和功能起調(diào)節(jié)作用,沒有直接參與酶的催化反應(yīng)。Walters等[42]利用NMR
- 氣相色譜的優(yōu)點(diǎn)與特色是什么?
- 氣相色譜與液相色譜相似,只是以氣體作流動相,它的分離機(jī)理也是基于物質(zhì)在流動氣相和固定相(可為固體和液體)兩相間分配的不同而導(dǎo)致分離。Martin和Synge于1942年建立了液-液分配色譜的理論模式。同時提出了以氣體作流動相色譜分離的可能性。后James和Martin終于實(shí)現(xiàn)了氣-液色譜的實(shí)驗(yàn)。從此,氣相色譜因其獨(dú)特的分離功能而得到飛速的發(fā)展。
- 甲烷單加氧酶的譜學(xué)表征
- MMOH 結(jié)構(gòu)的譜學(xué)表征:一系列譜學(xué)研究表明,MMOH雙核鐵中心含有一個μ-氫氧橋(pr-hydr-oxo)結(jié)構(gòu),容易發(fā)生誘導(dǎo)變形,在反應(yīng)循環(huán)過程中受其它組分影響,可以隨外部環(huán)境的變化而改變。聯(lián)合使用多種譜學(xué)手段對MMOH的結(jié)構(gòu)變化進(jìn)行表征,有助于闡明MMO的反應(yīng)機(jī)理。根據(jù)文獻(xiàn)報道,在結(jié)構(gòu)化學(xué)中常用的各種現(xiàn)代光譜和波譜技術(shù),都可以用來研究MMOH雙鐵核中心的構(gòu)型變化。它們包括ESR (electron spin resonace, 順磁共振),Mossbauer, EXAFS(ex-tended
- 甲烷MMOH雙鐵核中心構(gòu)型
- 甲烷和分子氧的活化機(jī)理:為了闡明MMO可能的反應(yīng)機(jī)理,Rosenzweig 等對Bath菌的MMOH晶體分別在4C、- 160C進(jìn)行XFA表征。證明在一160°C時,雙核鐵中心由4個谷氨酸、2個組氨酸、1個乙酸基配位,但在4C時,乙酸配基則被水分子取代。因此在4C和一160C情況下,活性中心的構(gòu)型是不同的,如圖3-3所示。Shu等研究了OB3b的MMOH晶體活性中心結(jié)構(gòu),得出了同樣的結(jié)果。
- 甲烷 羥基化酶的晶體結(jié)構(gòu)
- 為詳細(xì)了解甲烷單加氧酶的空間結(jié)構(gòu)信息,1993年,Lippard領(lǐng)導(dǎo)的科研小組首先在Nature上報道了M.capsulatusBath菌的羥基化酶晶體結(jié)構(gòu),在學(xué)術(shù)界引起極大興趣。
羥基化酶經(jīng)過純化以后,他們對緩沖液、鹽濃度沉淀劑、溫度、pH、蛋白質(zhì)濃度等結(jié)晶參數(shù)進(jìn)行了1000 多次篩選,首次用真空擴(kuò)散法獲得了Bath菌的MMOH晶體,并進(jìn)行了X光單晶街射分析。