酶化學(xué)的研究范圍是什么
化學(xué)先生 / 2019-07-27
酶化學(xué)的研究范圍也可以參照化學(xué)催化,概括為酶的催化劑制備化學(xué)、酶的結(jié)構(gòu)化學(xué)和酶催化反應(yīng)化學(xué)三大部分。其核心內(nèi)容是研究酶的分離純化、結(jié)構(gòu)表征、催化功能和化學(xué)模擬。酶化學(xué)要解決的關(guān)鍵科學(xué)問題是綜合運(yùn)用各種物理化學(xué)手段,特別是現(xiàn)代譜學(xué)表征方法閘明酶的結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,最終達(dá)到用人工酶替代生物酶,在溫和或極端條件下完成化學(xué)催化難以完成的反應(yīng)。
1.酶的催化劑制備化學(xué)
酶催化劑和化學(xué)催化劑的最大區(qū)別是催化劑的制備。酶是天然存在的,只能從生物細(xì)胞中提取,而不能像化學(xué)催化劑一樣,通過化學(xué)方法來合成。因此,酶的催化劑制備化學(xué)必須以生物學(xué)為基礎(chǔ),對(duì)細(xì)胞、氨基酸、蛋白質(zhì)、核酸等生物化學(xué)知識(shí)有所了解。微生物菌種的選育發(fā)酵、細(xì)胞培養(yǎng)和蛋白質(zhì)的分離純化等是必須掌握的生化技術(shù)。酶的化學(xué)修飾、酶和細(xì)胞的固定化,以及米白質(zhì)工程和基因工程等分子生物學(xué)方法,則是改進(jìn)和提高酶的活性和穩(wěn)定性的重要途徑。模擬酶或人工酶是具有酶功能的化學(xué)催化劑。由于酶是復(fù)雜的生物大分子,很難從組成和結(jié)構(gòu)上進(jìn)行化學(xué)合成,只能在深入了解其活性中心結(jié)構(gòu)和反應(yīng)機(jī)理的基礎(chǔ)上,對(duì)其催化功能進(jìn)行化學(xué)模擬。
2.酶催化反應(yīng)化學(xué)
酶催化反應(yīng)的突出特點(diǎn)是反應(yīng)條件溫和、反應(yīng)速率快,選擇性高。由于受到生存條件的限制,要保持酶的活性,酶催化反應(yīng)一般均在室溫、 中性pH等溫和條件下進(jìn)行,而且反應(yīng)物的濃度不能過高。其反應(yīng)速率之所以能比化學(xué)催化快數(shù)百億倍,是由于酶和底物生成的反應(yīng)中間物可以大大降低活化能。酶催化反應(yīng)化學(xué)的研究不注重單程轉(zhuǎn)化,而關(guān)心酶的轉(zhuǎn)化數(shù)。因?yàn)槊复呋姆磻?yīng)產(chǎn)物是生物新陳代謝的排泄物,對(duì)酶有毒,其濃度最高不能超過10%,從而限制了酶催化反應(yīng)的單程轉(zhuǎn)化率和生產(chǎn)強(qiáng)度。這也是在相同生產(chǎn)能力下,生物催化反應(yīng)器的尺寸要比化學(xué)催化反應(yīng)器大很多的原因。酶催化反應(yīng)的另一個(gè)弱點(diǎn)是酶的穩(wěn)定性差,由于酶是蛋白質(zhì),對(duì)外界的條件和環(huán)境非常敏感,容易因溫度、壓力的變化和雜質(zhì)的影響而失活。酶催化的選擇性,包括化學(xué)選擇性、立體選擇性和反應(yīng)分子的部位選擇性,則是化學(xué)催化無法比擬的。因此選擇性和穩(wěn)定性是酶催化反應(yīng)化學(xué)的研究重點(diǎn)。酶催化在水溶液中進(jìn)行,遵從米氏動(dòng)力學(xué)規(guī)律,反應(yīng)動(dòng)力學(xué)的研究比化學(xué)催化,特別是氣固多相催化反應(yīng)要簡(jiǎn)單得多。但由于酶催化屬于快速反應(yīng),反應(yīng)機(jī)理的研究,尤其是反應(yīng)中間物和反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)必須通過停留和溫度跳躍等快速動(dòng)力學(xué)方法測(cè)定。
近年來,極端條件,如有機(jī)溶劑、酸堿性(pH)、 低溫和高壓條件下生物催化反應(yīng)的發(fā)現(xiàn),已引起生物和化學(xué)工作者的普遍關(guān)注,對(duì)酶催化反應(yīng)化學(xué)的研究提出了新的挑戰(zhàn)。
3.酶的結(jié)構(gòu)化學(xué)
ssm酶是具有催化功能的蛋白質(zhì)。研究酶的結(jié)構(gòu)化學(xué),首先要了解蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),對(duì)蛋白質(zhì)的初級(jí)結(jié)構(gòu)氨基酸、肽鏈,以及由它們形成的高級(jí)結(jié)構(gòu)a螺旋和β折疊等空間構(gòu)型有一定的基礎(chǔ)知識(shí)。但更重要的是從結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系人手,研究酶的活性中心結(jié)構(gòu),酶和底物形成的反應(yīng)中間物,以及輔酶、輔因子等?,F(xiàn)代譜學(xué)表征技術(shù)的發(fā)展使酶的空間構(gòu)型和活性中心結(jié)構(gòu)以及酶和底物相互作用的研究進(jìn)入了一個(gè)嶄新階段。人們不但可以用X射線晶體衍射測(cè)定酶分子的晶體結(jié)構(gòu),而且能夠通過ESR、NMR、XAFS等研究酶的活性中心結(jié)構(gòu)、酶和底物的作用機(jī)理和反應(yīng)動(dòng)態(tài)學(xué)。分子生物學(xué)的發(fā)展和計(jì)算機(jī)的應(yīng)用,則使人們有可能通過基因突變改造酶和模擬酶的空間結(jié)構(gòu),從而提高自然酶的活性、穩(wěn)定性和對(duì)儲(chǔ)存環(huán)境及反應(yīng)條件的耐受性。